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      技術訊息

      土壤微生物分子生態技術服務

      作者:admin 來源:本站 發布時間: 2024-05-02 22:01  瀏覽次數:
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      土壤微生物分子生態技術服務 

      1.     土壤理化性質測定

      測定土壤全量和有效C、N、P、K等土壤營養元素含量。

      2.     熒光底物土壤酶活性測定

      按(Saiya-Cork et al. 2002) 的方法,采用熒光底物測定土壤中Urease,Acid phosphataseβ-glucosidase,α-glucosidaseCellobiohydrolase,β-xylosidase等酶活性。

      3.     PLFA群落分析

      采用美國MIDI公司的Sherlock群落分析軟件研究土壤微生物群落的PLFA指紋圖譜。分析土壤微生物群落結構,進行PCA和RDA等多變量分析,建立與土壤性質和功能的聯系。

      4.     變性梯度凝膠電泳(DGGE)

      按(Muyzer et al. 1993)的原理,制作細菌(16S)、真菌(18S、ITS)、氨氧化細菌和古菌(amoA)、甲烷氧化菌(pmoA)等土壤微生物的變性梯度電泳圖,分析土壤微生物群落結構,進行PCARDA等多變量分析,建立與土壤性質和功能的聯系。

      5.     末端限制性片段長度多態性(T-RFLP)

      按(Liu et al. 1997)的原理,分析細菌(16S)、真菌(18S、ITS)、氨氧化細菌和古菌(amoA)、甲烷氧化菌(pmoA)等土壤微生物的酶切片段多態性,分析群落結構,進行PCARDA等多變量分析,建立與土壤性質和功能的聯系。

      6.     實時熒光定量pcr(Real-time PCR)

      7.     穩定同位素探針技術(SIP)

      按(Neufeld et al. 2007)的方法,研究同化13C-15N-底物(如13C-glucose,15N-Urea等)的活性功能微生物。

       

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      參考文獻

      1.       Liu W T, Marsh T L, Cheng H and Forney L J 1997 Characterization of microbial diversity by determining terminal restriction fragment length polymorphisms of genes encoding 16S rRNA. Applied and environmental microbiology 63, 4516-4522.

      2.       Muyzer G, De Waal E C and Uitterlinden A G 1993 Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA. Applied and environmental microbiology 59, 695-700.

      3.       Neufeld J D, Vohra J, Dumont M G, Lueders T, Manefield M, Friedrich M W and Murrell J C 2007 DNA stable-isotope probing. Nature protocols 2, 860-866.

      4.       Saiya-Cork K R, Sinsabaugh R L and Zak D R 2002 The effects of long term nitrogen deposition on extracellular enzyme activity in an Acer saccharum forest soil. Soil Biology and Biochemistry 34, 1309-1315.

       

       

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